Indonesia merupakan salah satu negara dengan keanekaragaman hayati yang paling tinggi di dunia. Namun, keanekaragaman jenis tumbuhan yang tinggi ini mengalami ancaman kepunahan yang tinggi di alam dan memerlukan usaha konservasi yang efektif dan menyeluruh agar bisa tetap lestari dan dapat dimanfaatkan oleh manusia secara berkelanjutan. Selain melalui konservasi in situ dengan cara melestarikan suatu jenis di habitat alaminya, konservasi ex situ merupakan metode konservasi yang semakin mempunyai peranan penting bagi penyelamatan tumbuhan terancam punah. Oleh karena itu, diperlukan riset dan inovasi yang terarah dan fokus dalam upaya usaha mengonservasi tumbuhan terancam punah yang ada di Indonesia.

Riset terkait konservasi ex situ tumbuhan di dalam Rumah Program Tumbuhan Terancam Kepunahan yang Terkonservasi terbagi menjadi dua tema besar yaitu Konservasi ex situ tumbuhan dan Biologi tumbuhan untuk pemanfaatan tumbuhan secara berkelanjutan. 

Tema 1. Konservasi ex situ tumbuhan akan berfokus pada penguasaan teknologi kunci untuk konservasi tumbuhan terancam kepunahan dan upaya mengembalikan tumbuhan terancam kepunahan ke alam baik itu melalui program reintroduksi maupun reinforcement. Pengembalian tumbuhan terancam kepunahan tersebut tentu saja perlu direncanakan dengan baik terutama penguasaan teknologi kunci perbanyakan dan invigorasi tumbuhan dan perencanaan program reintroduksi dan/atau reinforcement. 

Tema 2. Biologi tumbuhan untuk pemanfaatan tumbuhan secara berkelanjutan akan memfokuskan pada riset-riset berbasis eksperimen dalam pengembangan potensi tumbuhan Indonesia terutama working collection yang ada di Kebun Raya Indonesia. Topik pemanfaatan secara berkelanjutan baik itu secara langsung maupun tidak langsung terhadap jenis-jenis tumbuhan terancam kepunahan akan menjadi fokus utama kegiatan pada tema kedua ini. 

Kegiatan riset di dalam rumah program ini merupakan kombinasi antara penelitian lapangan dan penelitian laboratorium yang berfokus pada tumbuhan terancam kepunahan Indonesia (1137 spesies) dan tumbuhan terancam kepunahan koleksi ilmiah Kebun Raya Indonesia (331 spesies). Hasil-hasil riset konservasi ex situ tumbuhan terancam kepunahan yaitu spesies tumbuhan terancam kepunahan yang terkonservasi, draft WGS (whole genome sequencing), dan PVT terdaftar.